分子夾雑の生命化学

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ポスター発表 A02班

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  1. 造住 有輝, 山口 野乃花, 嶋田 直彦, 杉本 直己, 丸山 厚, 三好 大輔, ヒストン模倣高分子のエピジェネティック修飾によるDNA との結合親和性への影響,11回バイオ関連化学シンポジウム, 2017.9.7
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  2. 田辺 和也, 三好 大輔, 杉本 直己, 中野 修一, ハイスループット解析による核酸と生体低分子の相互作用評価, 11回バイオ関連シンポジウム,2017.9.79
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  3. 堀田 政夫, 森本 隆太, 中井 大樹, 杉本 直己, 中野 修一,細胞内模倣環境における核酸と蛋白質の非特異的な相互作用の評価, 11回バイオ関連シンポジウム, 2017.9.79
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  4.  K.Tanabe, D.Miyoshi, N.Sugimoto, S.Nakano, “Evaluation of interactions between DNA G-quadrplex and small biomolecules selected by high-throuput screenin,44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.11.1415
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  5. H.Fujita, Y.Kataoka, Y.Nakajima, M.Yamada, N.Sugimoto, M.Kuwahara, “Specific light-up system based on signal amplification by ternary initiation complexes, 44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.11.1415 
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  6. T.Endoh, Y.Nagano, S.Ogasawara, H.Tamiaki, N.Sugimoto, “N-Methyl modification transforms a chlorophyll derivative into a G-quadruplex stabilizing ligand, 44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.11.1415 
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  7. J.Jana, T.Endoh, Y.Kataoka, S.Sato, S.Takenaka, M.Kuwahara, N.Sugimoto, “A fluorescence based screening system for ligands targeting non-canonical DNA structures, 44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.11.1415
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  8. Y.Teng, H.Tateishi-Karimata, N.Sugimoto, “Does molecular crowding regulate C9orf72-related ALS/FTD diseases by RNA foci formation?, 44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.1.1415
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  9. H.Tateishi-Karimata, K.Kawauchi, T.Ohyama, N.Sugimoto, “Relationship between malignant alteration in cancer cells and the transcript mutations byG-quadruplex formations in the template DNA, 44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.1.1415
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  10. T.Ohyama, H.Tateishi-Karimata, S.Takahashi, S.Sato, S.Tanaka, S.Takenaka, N.Sugimoto, “The stabilization mechanism of cyclic naphthalene diimide binding with various topology of G-quadruplexe, 44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.11.1415
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  11. Y.Zouzumi, N.Yamaguchi, N.Shimada, N.Sugimoto, A.Maruyama, D.Miyoshi,“Regulation of DNA structure and stability by combined effects of histone-mimicking polymers and osmolytes, 44回国際核酸化学シンポジウム, 2017.11.1415
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  12.  建石寿枝, 杉本直己, 水和イオン液体中で機能するDNAセンサー, 8回イオン液体討論会, 2017.11.2324
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  13. H. Tateishi-Karimata, K. Kawauchi, T. Ohyama, and N. Sugimoto, Effect of chemical environment change by malignant alteration in cancer cells on transcript productions from G-rich template DNAs, ISBC2017 (Uji, JAPAN) 2017.12.14-16 
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  14. S. Takahashi, J. A. Brazier, and N. Sugimoto, Non-canonical DNA structures control DNA replication by topology-dependent manner, ISBC2017 (Uji, JAPAN) 2017.12.14-16 
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  15. Yu-ki Zouzumi, Takafumi Miyata, Naohiko Shimada, Atushi Maruyama, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi
    Development of cell nucleus mimicking system based on molecular crowding effects on DNA structures
    2nd International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2017)
    Kihada Hall, Kyoto University, 2017.12.14-16 
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  16. 今川 佳樹、小畠 一起、寺田 康介、前田 龍一、中野 修一、杉本 直己、三好 大輔
    グアニン四重らせん構造選択的化合物のスクリーニングおよび機能解析
    11回バイオ関連化学シンポジウム、東京大学 弥生キャンパス, 2017.9.7-9 
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  17. A. B. Rode, T. Endoh, and N. Sugimoto,   Dynamic Aptamers as New Pharmaceutical Targets, APTAMERS 2017, Palais de la Bourse, Bordeaux, France, 2017.9.22-9.23
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  18. 遠藤玉樹, 杉本直己,  mRNA構造のダイナミクスを考慮した疾患関連遺伝子の発現制御技術の構築, 2017年度生命科学系学会合同年次大会, 神戸ポートアイランド(神戸国際会議場、神戸ポートピアホテル、神戸国際展示場、神戸商工会議所), 2017.12.6-12.9
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  19.  H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto, Improved Efficiency of mRNA Sensing System by a Hydrated Ionic Liquid, Gordon Research Conference(Bioanalytical Sensors), Salve Regina University, 2018.6.24-6.29 
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  20. 建石寿枝, 川内敬子, 杉本直己がん細胞の悪性化に及ぼすDNA四重鎖構造の解離と転写変異の影響, 日本核酸医薬学会第4回年会,九州大学医学部, 2018.7.9-11
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  21.  建石寿枝, 川内敬子, 大山達也, 杉本直己, カリウムチャネルはがん遺伝子の転写活性をDNA四重鎖の形成によって制御しているのか?, 12回バイオ関連化学シンポジウム,大阪大学(吹田キャンパス), 2018.9.9-11
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  22. 遠藤玉樹, 杉本直己, 植物由来の天然代謝産物と核酸構造との相互作用解析, 12回バイオ関連化学シンポジウム大阪大学(吹田キャンパス),2018.9.9-11
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  23. Teng Ye, 建石寿枝, 杉本直己, Gelation of RNA repeats in ALS/FTD is promoted in crowding conditions,12回バイオ関連化学シンポジウム大阪大学(吹田キャンパス), 2018.9.9-11
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  24. 大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己, ポリエチレングリコールにより誘起される分子クラウディング環境がDNA四重鎖の構造安定性に与える影響の分子シミュレーション解析, 12回バイオ関連化学シンポジウム, 大阪大学(吹田キャンパス), 2018.9.9-11
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  25. T. Endoh, N. Sugimoto, “Optimization of junction sequence between two aptamers for constructing signaling aptamer by using RNA library on microspheres45回国際核酸化学シンポジウム, 京都大学(吉田キャンパス), 2018.11.7-9
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  26. T. Ohyama, H.Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto, “Investigation for effects of polyethylene glycols on DNA structure and stability using molecular dynamics simulations, 45回国際核酸化学シンポジウム, 京都大学(吉田キャンパス), 2018.11.7-9
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  27. Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto, “Phase separation of repeated RNA with amyloid-like protein in neurodegenerative diseases is promoted by RNA G-quadruplexes,
    45回国際核酸化学シンポジウム, 京都大学(吉田キャンパス), 2018.11.7-9
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  28. H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto, “Effect of G-quadruplex stability and structure in the template DNA on transcript mutations in normal and cancer cells, 45回国際核酸化学シンポジウム, 京都大学(吉田キャンパス), 2018.11.7-9
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  29. K. McQuaid, J. Hall, H. Abell1, S. Takahashi, N. Sugimoto, D. Allan, D. Cardin, J. Brazier, and C. Cardin, “Structural Perspectives of the DNA binding properties of Ruthenium Polypyridyl Complexes, 45回国際核酸化学シンポジウム, 京都大学(吉田キャンパス), 2018.11.7-9
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  30. S. Takahashi, S. Bhowmik, S. Ghosh, and N. Sugimoto, “Transformation of selective i-motif DNAs into hairpin-like structures induced by a flavonoid compound, 45回国際核酸化学シンポジウム, 京都大学(吉田キャンパス), 2018.11.7-9 
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  31. S. Ghosh, S. Takahashi, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, S. Hazra, and N, Sugimoto, “Effects of molecular crowding on nearest-neighbor rules for Watson-Crick self-complementary DNA duplexes, 45回国際核酸化学シンポジウム, 京都大学(吉田キャンパス), 2018.11.7-9
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  32. 七種和美、渕上壮太郎、明石知子、巨大タンパク質-DNA複合体NCPのイオンモビリティ質量分析と構造計算、第7回イオン移動度研究会、立教大学(東京)、2018.4.14.
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  33. 七種和美、渕上壮太郎、明石知子、イオンモビリティ質量分析で得られたヌクレオソームの構造多様性、第66回質量分析総合討論会、ホテル阪急エキスポパーク(吹田)2018.5.1518.
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  34. Saikusa, K., Osakabe, A., Kato, D., Fuchigami, S., Nagadoi, A., Nishimura, Y., Kurumizaka, H., Akashi, S., XXII International Mass Spectrometry Conference, Fortezza da Basso, Florence, Italy, 2018.8.26-31.
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  35. 日高はる菜、泉俊輔、明石知子、七種和美、質量分析によるヌクレオソームにおけるヒストンアセチル化の解析、第56回日本生物物理学会年会、岡山大学(岡山)、2018.9.1517.
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  36. 橋本洸平、長土居有隆、小沼剛、明石知子、(CCG)n配列を含む二重鎖DNAからなるヌクレオソームコア粒子の再構成の試み、第41回日本分子生物学会年会、パシフィコ横浜(横浜)、2018.11. 2830.
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  37. Y. Imagawa, N. Sugimoto, D. Miyoshi, Fluorescence detection of DNA G-Quadruplex by ZnAPC,  FIBER International Summit for Nucleic Acids 2018 (FISNA 2018), Konan University, Kobe, 2018.7.5
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  38. K. Kohata, N. Sugimoto, D. Miyoshi, High throughput screening system for DNA I-motif structure ligands, FIBER International Summit for Nucleic Acids 2018 (FISNA 2018), Konan University, Kobe,  2018.7.5
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  39. 今川佳樹, 杉本直己, 三好大輔, ZnAPC を利用したNRAS G4 の選択的検出,12回バイオ関連化学シンポジウム, 大阪大学吹田キャンパス, 2018.9.9
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  40. 小畠一起, 杉本直己, 三好大輔, DNA I-motif 構造形成に伴う蛍光発光を用いたI-motif の新規検出法, 12回バイオ関連化学シンポジウム, 大阪大学 吹田キャンパス, 2018.9.9
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  41. K. Kohata, N. Sugimoto, D. Miyoshi, Phase separation of nucleic acids induced by cationic peptides and molecular crowding conditions, 45th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC 2018), Kyoto University, Kyoto, Japan, 2018.11.7
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  42. Y. Imagawa, K. Kohata, N. Sugimoto, D. Miyoshi, Identification of DNA G-quadruplex and i-motif binding ligands by a fluorescent screening system, 45th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC 2018), Kyoto University, Kyoto, Japan, 2018.11.7
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  43. K. Tanabe, M. Horita, S. Morita, D. Miyoshi, N. Sugimoto, S. Nakano, Increments in the thermal stability of G-quadruplexes with a long loop using bulky cations, 45th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC 2018), Kyoto University, Kyoto, Japan, 2018.11.7
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  44. Y. Sugitani, Y. Zozumi, N. Sugimoto, and D. Miyoshi, Combined effects of DNA methylation and molecular crowding on thermodynamics of DNA duplex, KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5 
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  45. K. Nagano, S. Kinugasa, N. Sugimoto, and D. Miyoshi, High-throughput screening of G-quadruplex-selective ligands in the presence of excess DNA duplex, KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5 
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  46. Kohata, N. Sugimoto, and D. Miyoshi, Intrinsic fluorescence of DNA I-motif structures in sequence specific manner, KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5
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  47. Y. Imagawa, N. Sugimoto, and D. Miyoshi, Selective fluorescence detection and transcriptional repression of DNA G-quadruplex by ZnAPC , KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5 
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  48. D. Miyoshi, A new photodynamic therapy targeting mRNA G4, KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5 
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  49. 高橋巧,小井川浩之,須河光弘,高橋聡,マイクロ秒分解一分子蛍光測定によるF1-ATPase構造変化追跡,第18回日本蛋白質科学会年会朱鷺メッセ(新潟), 2018.6.26-2. 
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  50. S. Nakano, H. Oikawa, S. Takahshi, Investigation on the structural properties of proteins included in non-membraneous granule droplets,  The 56th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Tsushima Campus, Okayama University, Okayama, Japan, 2018.9.15-17.  
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  51. H. Urabe, S. Nakano, Y. Shimizu, N. Mikosiba, H. Oikawa, S. Takahashi, Improvement of the fluorescent detected phage sorter for the application to phage display, Tsushima Campus, Okayama University, Okayama, Japan, 2018.9.15-17.  
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  52. S. Kamonprasertsuk, H. Oikawa, S. Takahashi, Ultra-fast dynamics of simple polyalanine peptides by using nanosecond region fluorescence correlation spectroscopy, Tsushima Campus, Okayama University, Okayama, Japan, 2018.9.15-17.  
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  53. Kohata, N. Sugimoto, and D. Miyoshi, Intrinsic fluorescence of DNA I-motif structures in sequence specific manner, KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5      
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  54. Y. Imagawa, N. Sugimoto, and D. Miyoshi, Selective fluorescence detection and transcriptional repression of DNA G-quadruplex by ZnAPC , KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5
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  55. D. Miyoshi, A new photodynamic therapy targeting mRNA G4, KONAN RESEARCH SUMMIT, Konan University, Kobe, Japan, 2018.12.5
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  56. 高橋巧,小井川浩之,須河光弘,高橋聡,マイクロ秒分解一分子蛍光測定によるF1-ATPase構造変化追跡,第18回日本蛋白質科学会年会朱鷺メッセ(新潟), 2018.6.26-2.
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  57. S. Nakano, H. Oikawa, S. Takahshi, Investigation on the structural properties of proteins included in non-membraneous granule droplets,  The 56th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Tsushima Campus, Okayama University, Okayama, Japan, 2018.9.15-17. 
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  58. H. Urabe, S. Nakano, Y. Shimizu, N. Mikosiba, H. Oikawa, S. Takahashi, Improvement of the fluorescent detected phage sorter for the application to phage display, Tsushima Campus, Okayama University, Okayama, Japan, 2018.9.15-17. 
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  59. S. Kamonprasertsuk, H. Oikawa, S. Takahashi, Ultra-fast dynamics of simple polyalanine peptides by using nanosecond region fluorescence correlation spectroscopy, Tsushima Campus, Okayama University, Okayama, Japan, 2018.9.15-17. 
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  60. Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto, Molecular Crowding Regulates RNA Phase Separations in Repeat Expansion Disorders, Gordon Research Conference(RNA Nanotechnology), Four Points Sheraton / Holiday Inn Express, Ventura, CA, US, 2019.1.13-18
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  61. 高野航太朗, 七種和美, 小沼剛, 明石知子夾雑環境下でのネイティブ質量分析71回イオン反応研究会, 横浜, 2018.12.1
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  62. H. Ushijima, R. Maekawa, E. Igarashi, S. Akashi, Accurate Mass Determination of Long DNA Fragments Prepared for Structural Biology Study of Epigenetic DNA methylation, The 67thASMS Conference、Atlanta, 2019.6.2-6
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  63. S. Kamonprasertsuk, H. Oikawa, S. Takahashi, Dynamics of the helix-coil transition of alanine-based polypeptides detected by nanosecond region fluorescence correlation spectroscopy, 第13回分子科学討論会, 名古屋大学 東山キャンパス, 2019.9.17-20. Tags: 小井川A02
  64. H. Senmaru, H. Oikawa, S. Takahashi, Microsecond-resolved observation of F1-ATPase conformational changes by single molecular fluorescence spectroscopy, The 57th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Seagaia Convention center, Miyazaki, Japan, 2019.9.24-26. Tags: 小井川A02
  65. S. Kamonprasertsuk, H. Oikawa, S. Takahashi, Dynamics of the helix-coil transition of alanine-based polypeptides detected by nanosecond region fluorescence correlation spectroscopy, The 57th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Seagaia Convention center, Miyazaki, Japan, 2019.9.24-26. Tags: 小井川A02